实验室作为内蒙古大学相对独立的研究机构，成立了由学校主管副校长牵头的实验室建设管理委员会，保障和监督管理和年度考核实验室工作，协调解决实验室发展中的重大问题。

实验室实行主任负责制和学术委员会评审制，实验室主任由学校公开招聘生态学领域高水平学术带头人担任，实验室学术委员会由学校聘任，主任委员由校外专家担任。

实验室组织结构图